
ขณะที่พันธมิตรของโลกอ่อนกำลังลง ฮะรุโอะจึงชั่งใจคิดที่จะเข้าร่วมกับฝ่ายเอ็กซิฟ ซึ่งลัทธิอันตรายของฝ่ายดังกล่าวกำลังวางแผนปลุกสัตว์ประหลาดร้ายที่อาจทำลายล้างโลกหลังจากการทำลาย Mechagodzilla City Bilusaludo ที่เหลืออยู่ใน Aratrum เรียกร้องความยุติธรรมให้ Haruo ทำลายสิ่งที่พวกเขาเห็นว่าจำเป็นเพื่อเอาชนะ Godzilla มนุษย์ไม่เห็นด้วยโดยเชื่อว่า Haruo เ
ปิดเผยความตั้งใจที่แท้จริงของ Bilusaludo ในการดูดกลืนโลก การก่อจลาจลของ Bilusaludo และปิดห้องเครื่องของเรือบังคับให้เรือวิ่งโดยใช้แบตเตอรี่สำรองในอีกสองวันข้างหน้า บนโลกนี้ฮารุโอะได้เรียนรู้จากดร. มาร์ตินว่ายูโกะถูกทำให้สมองตายโดยมีนาโนเมตรในร่างกายทำให้เธอมีชีวิตอยู่ นอกจากนี้เขายังได้เรียนรู้ว่าผู้ที่ได้รับการรักษาโดย Houtua
รอดชีวิตจากความพยายามของนาโนเมตรในการดูดซับพวกมันโดย Methphies หลอกลวงผู้รอดชีวิตให้เชื่อว่าการมีชีวิตรอดของพวกเขาเป็นการแทรกแซงจากพระเจ้า เมื่อต้องเผชิญหน้ากับฮารุโอะเกี่ยวกับการเปลี่ยนมนุษย์ที่เหลือ Methphies เปิดเผยแผนการของเขาที่จะนำเทพเจ้าของ Exifs มายังโลกและต้องการความช่วยเหลือของ Haruo
เพื่อให้เป็นไปได้ ดร. มาร์ตินแนะนำให้ฮารุโอะซ่อนตัวจนกว่าความตึงเครียดจะคลี่คลาย ฮารุโอะถูกพาไปยังแคมป์ห่างไกลโดยฝาแฝด Houtua, Maina และ Miana Miana อธิบายเป็นการส่วนตัวกับ Haruo ว่าคนของเธอไม่มีแนวคิดเรื่องความเกลียดชังและแนวคิดเกี่ยวกับชีวิตของพวกเขาวนเวียนอยู่กับการ “ชนะ” (การอยู่รอดและการสร้างชีวิต)
หรือ “การสูญเสีย” (ตายแล้วหายไป) เธอบอกฮารุโอะว่าเขา “แพ้” และเสนอที่จะ “เชื่อมต่อชีวิต” กับเขา แต่เขากลับทำให้เธอผิดหวัง เมื่อไมนายื่นข้อเสนอเดียวกันในภายหลังเขาก็ตระหนักว่าเธอเป็นคนที่ช่วยเขาไว้ไม่ใช่มิอานาน้องสาวของเธอและยอมรับ Miana ค้นพบ Metphies ที่สื่อสารทางโทรจิตกับ Endurph Exif เปิดเผยแผนการของเขาสั้น ๆ
ก่อนที่จะจับตัวเธอขณะที่เธอติดต่อทางโทรจิตกับ Haruo และ Maina ต่อมา Metphies ได้ทำพิธีกรรมร่วมกับผู้ติดตามของเขาร่วมกับ Endurph เพื่อเรียก Ghidorah เทพเจ้าของพวกเขาออกมาเพื่อเอาชนะ Godzilla Ghidorah ปรากฏเป็นเงาบนโลกและบางส่วนผ่านความเป็นเอกฐานกลืนกินลูกน้องของ Metphies และทำลาย Aratrum จากนั้น Ghidorah ก็เข้าโจมตี Godzilla
ซึ่งทำอะไรไม่ถูกกับสัตว์ประหลาดที่จับต้องไม่ได้ในขณะที่หัวของมันกัด Godzilla และทำให้พลังงานหมดไป มาร์ตินสรุปว่าร่างที่แท้จริงของ Ghidorah มีอยู่ในอีกระนาบหนึ่งของการดำรงอยู่และกำลังได้รับคำแนะนำจากใครบางคนในจักรวาลของพวกเขา Haruo พบว่ามันเป็น Metphies
ที่แทนที่ตาขวาของเขาด้วยเครื่องรางที่เขาซ่อมแซมด้วยนาโนเมตร Metphies ดำเนินการเพื่อเปิดเผยว่าผู้คนของเขาอุทิศตนให้กับ Ghidorah ตั้งแต่เรียนรู้ความจริงที่แท้จริงว่าจักรวาลของพวกเขามีขอบเขต จำกัด และเผชิญกับการทำลายล้างโดยทำงานเพื่อเสนอดาวเคราะห์สัตว์ประหลาดให้กิน
การดำเนินการทางโทรจิตทำร้าย Haruo Metphies อธิบายว่าความเกลียดชังของมนุษย์ที่มีต่อก็อตซิลล่าทำให้เขาเป็นเครื่องบูชาในอุดมคติและบอก Haruo ว่าเขาต้องยอมจำนนต่อ Ghidorah ในฐานะพยานเพื่อให้การสำแดงเต็ม Maina และ Dr. Martin ใช้ไข่ของเทพเจ้า Houtuan เพื่อเข้าถึง Haruo
และเปิดเผยวิธีหยุด Ghidorah Haruo ได้เรียนรู้ว่า Metphies จัดเตรียมการตายของกลุ่มสำรวจ Tau Ceti e เพื่อให้พวกเขา “รอด” ในขณะเดียวกันฮารุโอะก็นึกถึงเสน่ห์ที่เขาสูญเสียไปในวันที่เขาหนีจากโลกเมื่อตอนเป็นเด็ก ภาพดอกไม้ทำให้เขานึกถึงความหมายของชื่อ “ฤดูใบไม้ผลิ” และพลังแห่งความหวังที่จะเอาชนะความสิ้นหวัง
จากนั้น Haruo ก็แยกตัวเป็นอิสระและทำลายเครื่องรางของ Metphies ทำให้ Ghidorah ได้รับผลกระทบจากฟิสิกส์ของโลกและในที่สุดก็อดซิลล่าพ่ายแพ้ Metphies ตายบอก Haruo ว่า Ghidorah จะเฝ้าดูเขาตลอดไปตราบเท่าที่เขายังมีชีวิตอยู่ เวลาผ่านไปเมื่อผู้รอดชีวิตฝังอาวุธและรวมเข้ากับสังคมฮูทัวโดยที่เมนอาตั้งท้องลูกของฮารุโอะ
ดร. มาร์ตินบอกฮารุโอะว่าเขามีหุ่นยนต์อีแร้งตัวสุดท้ายที่ทำงานได้โดยได้ค้นพบวิธีใช้นาโนเมตรของ Mechagodzilla ในร่างกายของยูโกะเป็นเครื่องมือในการสร้างอารยธรรมขึ้นมาใหม่เหมือนเดิม ดวงตาข้างขวาของฮารุโอะเมื่อได้ยินเสียงของเมตฟีส์ว่าเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นในครั้งนี้จะช่วยให้ Ghidorah กลับคืนสู่ความเป็นจริง
พายูโกะไปกับเขาบอกเมนว่ามีหลายครั้งที่ผู้คนต้องเผชิญในวันที่พวกเขาเลือกที่จะต่อสู้กับการต่อสู้ที่แพ้ฮารุโอะกระตุ้นก็อตซิลล่าให้ทำลายเขาและร่องรอยทั้งหมดของนาโนเมตรที่มีชีวิตเพื่อประโยชน์ของโฮทัว ในฉากโพสต์เครดิต Maina ซึ่งแสดงสัญญาณของอายุที่เพิ่มมากขึ้นมองดูเด็ก ๆ กลุ่มหนึ่งทำพิธีกรรมเพื่อเคารพ Haruo โดยวางเชือกที่ผูกปมแทนความกลัวของพวกเขาลงในกองไฟใต้หุ่นไม้ของ Vulture Mech